Seçilebilir Marker ve Reporter Gen Arasındaki Fark | Seçilebilir Marker-Reporter Gene
Anahtar Difference - Seçilebilir Marker vs Reporter Gene
Genetik mühendislik tekniği önemli genlerin organizmadan başka bir organizmaya aktarılması için kullanılır. Yabancı bir genin bir başka organizmanın genomuna sokulması ve onu konakçı hücre içinde eksprese etmesi, gen aktarımında en zor adımlardır. Dönüştürme işleminin başarısını tespit etmek için rekombinant molekülde seçilebilir bir markör ve bir raportör gen kullanılır. Seçilebilir bir işaretleyici, dönüştürülmemiş hücrelerden dönüştürülmüş hücreleri eksprese eden ve seçen bir DNA dizisi veya bir genidir. Bir raportör gen, dönüştürülen hücreleri ayırt etmek ve yerleştirilen genin konakçıdaki işlevini nicelleştirmek veya saptamak için kullanılan başka bir gentir. Seçilebilir markör ve raportör gen arasındaki en önemli fark, raptör geni konakçı içindeki gen ekspresyon seviyesinin nicelleştirilmesi için kullanıldığı zaman dönüştürülemeyen hücreleri elemek ve dönüştürülen hücreleri işaretlemek için seçilebilir işaretçinin kullanılmasındandır.
İÇİNDEKİLER
1. Genel ve Anahtar Farkı
2. Seçilebilir İşaretleyici Nedir
3. Reporter Gen nedir
4. Yan yana Karşılaştırma - Seçilebilir Marker ile Muhabir Geni
5. Özet
Seçilebilir Bir İşaretçi Nedir?
Genetik mühendisliğinde, ilgi geni uygun bir vektöre yerleştirilir ve konak organizmalara dönüştürülür. Bununla birlikte, dönüşüm sadece yetkili konukçu hücrelerde başarılıdır ve konakçı hücrelerin yabancı DNA alımını reddetme ihtimali vardır. Bu nedenle, dönüştürülmüş ve dönüştürülmemiş hücrelerin farklılaşması, ileri deneylerle devam ettirmek için önemlidir. Bu nedenle araştırmacılar, dönüştürülmemiş hücrelerden dönüştürülmüş hücrelerin kolaylıkla seçilebilmesi için vektör için seçilebilir bir işaretleyici geni içermektedir. Seçilebilir bir marker, bir DNA sekansı, özellikle dönüştürülmüş hücrelerin tanımlanmasında yararlı bir gen. Bu işaretleyici gen, bir ortamda dönüştürülmemiş hücrelerin yapay bir seçimine uyan bir özellik sergiler.
Moleküler biyolojide kullanılan en yaygın seçilebilir işaretler antibiyotiklere dirençli genlerdir. Bir antibiyotik direnç geni vektöre yerleştirilir ve konak hücrelere, özellikle konak bakteri hücresine dönüştürülür. Bu belirli antibiyotik, bakteri üreterek kullanılan ortama dahil edilir. Seçici işaretlerin varlığı nedeniyle, seçici koşullar altında, yalnızca seçilebilir uygun işaretleyici içeren hücreler hayatta kalabilir.Transforme olmayan hücreler, antibiyotik içeren ortamda büyüyemez. Bu nedenle, antibiyotik dirençli seçilebilir işaretleyici nedeniyle, dönüştürülmüş hücreler kolayca tanımlanır.
Antimetabolitler için özellikler kazandıran genler, bitki genetik mühendisliğinde klonlama vektörlerinde seçici işaretleyiciler olarak herbisitler kullanılır. Bununla birlikte, selektif markörlerin genetiği değiştirilmiş organizmalara dönüştürülmesi çevre ve insan üzerinde olumsuz etkilere sahiptir. Antibiyotik dirençli bakterilerin salınması, insan patojenlerinin antibiyotik direncini artırabilir. Ürünü veya biyokütleyi antibiyotiklerle kirletebilir ve antibiyotiklerin bozunması ve inaktivasyonu sonucu seçici basıncı kaybedebilir.
Şekil 01: Seçilebilir işaretleyici
ile gen transferi için plasmid vektörü Bir Reporter Geni Nedir?
Reporter genleri, eklenen gen ekspresyonunun saptanmasını veya ölçülmesini sağlayan genlerdir. Bu raportör genleri, ekspresyon lokasyonlarını veya seviyelerini işaret etmek için ilgili genin düzenleyici sekanslarına tutturulabilir. Bu nedenle, aynı promotör altındaki genlerin ifadesi sırasında, bunlar tek bir mRNA dizisine transkribe edilir ve daha sonra, gen ifadesinin seviyesini gösterebilen bir proteine tercüme edilir.
Raportör genleri çeşitli türdedir ve genellikle flüoresan ve parlak proteinlerde yer alan görsel olarak tanımlanabilir özellikleri içerirler. Floresan proteini ve enzimleri kodlayan genler, başarılı gen ifadesine işaret ederek ve gen ifadesinin nicelendirilmesi için fırsat vererek görünmez substratları parlak veya renkli ürünlere dönüştürürler.
Şekil 02: Reporter Gen İfadesi
Seçilebilir İşaretleyici ve Reporter Geni arasındaki fark nedir?
- Diff Makale ->
Seçilebilir İşaretleyici - Raporlayıcı Geni |
|
| Seçilebilir işaretleyici, dönüştürülmemiş hücrelerle dönüştürülmüş hücreleri ayırt etmeye yardımcı olan bir DNA sekansı türüdür. | Reporter geni, konakçı hücrenin içine eklenen istenen genin ekspresyonunu nicelleştirmeye yardımcı olan bir gentir. |
| Üretilen Birimlerin Nitelikleri | |
| Genler, büyüyen medyada yapay seçime yardımcı olan özelliklerle kodlanmıştır. | Genler görsel olarak tanımlanabilen özelliklerle kodlanmıştır. |
| Kullanım | |
| Antibiyotik direnç genleri, antimetabolit genler, herbisit direnç genleri vb seçilebilir işaretleyici için örnektir. | Yeşil floresan protein, β-glukuronidaz, Kloramfenikol asetiltransferaz, Kırmızı floresan proteini vb. Için gen kodları örnektir. |
Özet - Seçilebilir Markör ve Raporlayıcı Geni
Seçilebilir işaretleyiciler, belirli antibiyotik veya herbisit ile dozlanan seçici ortamda transforme hücrelerin büyümesine izin verir. Dönüştürülmüş hücrelerin erken seçimi için kullanılırlar. Reporter genleri, arzulanan istenen genin ekspresyon seviyesinin nicelleştirilmesi için kullanılır. Ayrıca, dönüştürülmüş ve dönüştürülmemiş hücrelerin farklılaşmasına izin verirler. Bu, seçilebilir markör ve raportör gen arasındaki farktır.Hem seçilebilir marker hem de raportör gen, genetik mühendisliğinde önemli belirteçler olarak düşünülmektedir.
Kaynaklar:
1. Ziemienowicz, Alicja. "Bitki seçilebilir markerler ve muhabir genler. “SpringerLink'in. Springer-Verlag, n. d. Ağ. 23 Mart 2017.
2. Shih, Chen-Han, Hsiao-Yin Chen, Hung-Chieh Lee ve Huai-Jen Tsai. "Mor Kromoprotein Gen Microalga Nannochloropsis oculata'nın Transgenezi için Yeni Bir Seçim İşareti Olarak Hizmet Veriyor. "PLOS ONE. Halk Kütüphanesi, n. d. Ağ. 25 Mart 2017
Resim Nezaketleri:
1. "Plasmid with insert" Michael Jeltsch - Kendi çalışması (CC BY-SA 4. 0) Commons Wikimedia
yoluyla. "Reporter gen" TransControl tarafından en. wikipedia (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia
