VNTR ve STR arasındaki fark | VNTR-STR
Anahtar Farkı - VNTR ve STR
DNA araştırmaları, filogenetik ilişkilerin anlaşılması ve belirlenmesi, genetik hastalıkların teşhisi ve organizmanın genomlarının haritalanmasında büyük yarar sağlar. DNA analiziyle ilişkili çeşitli teknikler, belirli bir genin veya DNA dizisinin bilinmeyen bir havuzda tanımlanması için kullanılır. Genetik belirteçler olarak bilinirler. Genetik belirteçler, moleküler biyolojide bireyler ve türler arasındaki genetik çeşitliliği belirlemek için kullanılır. Değişken sayı tandem tekrarlaması (VNTR) ve kısa tandem tekrarlama (STR) bireyler arasında polimorfizm gösteren iki genetik belirteç türüdür. Her iki tip de, tandem tekrarlar olan kodlamayan tekrarlayan DNA'dır. Kromozomlarda kafa kuyruk modasına göre düzenlenmiştir. VNTR, kısa nükleotid dizisinin birkaç kez tekrarlandığı genomun bir bölümüdür. STR, genom içerisindeki, yüz kez iki ila on üç nükleotidden oluşan tekrar eden birimler halinde organize edilen DNA'nın bir başka bölümüdür. VNTR ve STR arasındaki en önemli fark tekrarlanan bir dizideki nükleotidlerin sayısıdır. VNTR'nin tekrar eden birimleri, 10 ila 100 nükleotitten oluşurken, STR biriminin tekrarlanması, 2 ila 13 nükleotidden oluşur . Adli tıp araştırmalarında VNTR ve STR yaygın olarak kullanılmaktadır.
İÇİNDEKİLER
1. Genel ve Anahtar Farkı
2. VNTR nedir
3. STR
nedir 4. VNTR ve STR arasındaki benzerlikler
5. Yanlamasına Karşılaştırma - VNTR-Tabla Formundaki STR'ye
6. Özet
VNTR Nedir?
Tandem tekrarlama, belirli bir kromozomal lokusta kafa kuyruk moda tekrarlanan kısa DNA dizisidir. Tandem tekrarında başka bir dizi veya nükleotid yoktur. Genomda birkaç tandem tekrarlar vardır. VNTR, aralarında, 10 ila 100 nükleotidden oluşan tekrar eden birimlere sahip, tandem tekrarlamanın bir türüdür. VNTR, minisatellite türüdür. Bu tandem tekrarlar birçok kromozomda bulunabilir. Bunlar, insan genomu içerisinde serpiştirilir ve ağırlıklı olarak kromozomların alt-telomerik bölgelerinde bulunurlar.
VNTR'ler bireyler arasında tandem tekrar polimorfizm göstermektedir. Kromozomun belirli bir yerindeki VNTR'nin uzunluğu, DNA bölümünde düzenlenen tekrar eden birimlerin sayısındaki değişikliğe bağlı olarak bireyler arasında oldukça değişkentir. Bu nedenle VNTR, kişilerin tanımlanmasında güçlü bir araç olarak kullanılabilir ve VNTR analizi, genetik, biyoloji araştırması, adli tıp ve DNA parmak baskısı gibi birçok alanda kullanılmaktadır.VNTR'ler, kemik iliği transplant engraktürünün miktarının belirlenmesinde kullanılan ilk genetik belirteçlerdir. VNTR'ler aynı zamanda adli tıp alanında DNA profillemesinde kullanılan ilk polimorfik belirteçlerdir.
Şekil-01: VNTR'lerin altı kişide değişimi
VNTR analizi kısıtlama fragmanı uzunluğu polimorfizminden sonra güney hibridizasyon ile gerçekleştirilir. Dolayısıyla, nispeten büyük bir DNA örneğine ihtiyaç duyar. VNTR profilinin yorumlanması da problemlidir. Bu sınırlamalar nedeniyle adli genetikte VNTR kullanımı sınırlıdır ve yerini STR analizine bırakmıştır.
STR nedir?
STR, iki ila on üç nükleotid tekrarlayan birimden tandem şeklinde düzenlenmiş oldukça tekrarlayan bir DNA bölümdür. STR, VNTR'ye benzer. Fakat VNTR'den, tekrar eden bir dizideki nükleotidlerin sayısından ve tekrarların sayısından farklılık gösterir. STR bir tür mikro sedatidir.
Yinelenen birimlerin tam sayısının ölçülmesine ilişkin STR analizi. STR'lar, VNT'lere benzer şekilde, bireyler arasında oldukça değişkendir. STR profilleri kişiden kişiye farklılık gösterir. Bu nedenle, moleküler biyolojide STR analizi, iki veya daha fazla numunedeki DNA'daki spesifik lokusları karşılaştırmak için kullanılır. Dolayısıyla STR'lar, moleküler biyolojide güçlü genetik belirteçler olarak düşünülür. Yüksek polimorfizm ve nispeten kısa boy olması nedeniyle kişilerin tanımlanması için mükemmel bir araç sağlar.
Günümüzde, STR, adli genetikte en çok kullanılan analiz edilen genetik polimorfizm aracıdır. Çoğu adli tıpkı STR polimorfik analizi içerir. STR lokusu genomun her tarafına yayılmıştır. Adli analizde kullanılabilen kromozomlarda binlerce STR bulunur. STR analizi, VNTR analizi gibi kısıtlama uzunluğu polimorfizmini içermez. STR analizi DNA'yı kısıtlama enzimleri ile kesmez. DNA üzerinde istenen bölgelerin yerleştirilmesi ve PCR tekniği kullanılarak spesifik problar kullanılır, STR'un uzunlukları belirlenir.
Şekil 02: Örnekler arasındaki STR değişimi
VNTR ve STR arasındaki benzerlikler nelerdir?
VNTR ve STR, kodlayıcı olmayan DNA'dır.
- Her ikisi de tandem tekrarlar.
- Her ikisi de, DNA bölümünün uzunluğundaki fark nedeniyle, bireyler arasında polimorfizm gösteriyor.
- Her ikisi de DNA parmak baskılarında ve adli araştırmalarda güçlü genetik belirteç olarak kullanılırlar.
- VNTR ve STR arasındaki fark nedir?
- diff Makale Tablo ->
VNTR - STR Öncesinde Orta> VNTR, tandem şekilde tekrarlanan kısa bir nükleotid dizisine sahip, kodlamayan, tekrar eden bir DNA'dır.
STR, iki ila on üç nükleotid tekrarlayan birimden tandem şeklinde düzenlenmiş oldukça tekrarlayan bir DNA bölümdür. |
|
| Boyut | VNTR'ler STR'lardan daha büyük. |
| STR'lar VNTR'lerden daha küçük. | |
| Tekrarlanan Sekans Sırasındaki Nükleotid Sayısı | VNTR'nin tekrar eden birimi, 10 ila 100 nükleotidden oluşur. |
| STR'un tekrar eden birimi 2-13 nükleotidden oluşur. | |
| Özet - VNTR ve STR | VNTR ve STR, moleküler biyolojide, özellikle de adli genetik alanında kullanılan iki güçlü genetik belirteçtir.VNTR, bir minisatellite tipidir ve STR, bir mikro sedatidir. VNTR ve STR, kodlamayan, oldukça tekrarlayan DNA'dır. Bunlar tandem tekrarlar. VNTR ve STR'un genel yapısı aynıdır. Bununla birlikte, tekrar eden dizideki nükleotidlerin sayısı ve uzunluğu farklıdır. VNTR, 10 ila 100 nükleotidden oluşan tekrarlanan sekanslara sahiptir. STR, 2 ila 13 nükleotidi kapsayan tekrar eden dizilere sahiptir. Bu, VNTR ve STR arasındaki farktır. |
VNTR ile STR
PDF sürümünü indirin Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve atıf notlarına göre çevrimdışı amaçlarla kullanabilirsiniz. Lütfen PDF versiyonunu buraya indirin VNTR ile STR arasındaki fark.
Kaynaklar:
1. "Adli Genetik Bilimi. "CRG - Sorumluluk Sahibi Genetik Konseyi. N. s., n. d. Ağ. Burada bulunabilir. 10 Temmuz 2017.
2. "STR analizi. "Vikipedi. Wikimedia Vakfı, 22 Mart 2017. Web. Burada bulunabilir. 10 Temmuz 2017.
Resim Nezaketleri:
1. "D1S80Demo" PaleWhaleGail tarafından İngilizce Vikipedi'de (CC BY-SA 3. 0) Commons Wikimedia aracılığıyla
