Plazmid ile Cosmid Arasındaki Fark
Plasmid vs Cosmid
Bilinen, Plasmid adı verilen başka bir DNA molekülü vardır. Hepimiz kromozom DNA'sı ve yapısı hakkında bilgi sahibiyiz. Bununla birlikte, mikrobiyologlar ve genetiği öğrenenler tarafından bilinen, Plasmid adı verilen başka bir DNA molekülü var. Bu, kendisini kromozomal DNA olmadan çoğaltan ve bunun olmadan var olabilen bir moleküldür. Normalde bakterilerde bulunurlar, ökaryotik organizmalarda da görülürler. Bunlar dairesel ve çift sarmallı oldukları anlamda bakteriyel DNA'dan farklıdır. Cosmids, in vitro olarak λ faj katlarına paketlenebilen özel plazmid türüdür. Bir kosmid kendisi de bir plasmid gibi çoğalabilir ve gen klonlama vektörü olarak kullanılabilir. Ancak, bu yazıda bahsedeceğimiz ikisi arasında farklılıklar var.
Plazmidler
Plazmidler uygun bir konukçu bulduklarında replikasyon yapabilen vektörlerdir. İlk olarak 1952'de Amerikalı bilim adamı Joshua Lederberg tarafından keşfedildi. Plazmidler, bir yaşam biçimi olmaması anlamında virüslere benziyor. Bununla birlikte, virüslerden farklı olarak, yeni bir ev sahibine transfer için gerekli genleri kodlamadan DNA'dırlar. Genetik ve moleküler biyolojide yoğun şekilde kullanılırlar ve hatta ticari olarak kullanılırlar. Laboratuarda sıçan genetik hastalıklarının yaratılmasında plazmid yaygın olarak kullanılır. Gen terapisi için de kullanılırlar.
Tek bir hücrede pek çok farklı plasmid bulunabilir. Bilim adamları, E. coli'de farklı plazmidlerin varlığını kanıtladılar.
Cosmids
Cosmids, 1978'de Collins ve Hohn bilim adamları tarafından keşfedilen bir plasmid türüdür. Aslında, cos sekansı içeren hibrid plasmidlerdir. DNA dizilerini sadece 1-20 kb DNA taşıyabilen plazmidlerden önemli ölçüde daha yüksek olan 37-52 kb ayarına taşıyabiliyorlar. Bunlar, faj kapsidleri içine paketlenebilmeleri açısından farklıdır. Plazmidler, belirli miktarda DNA kendilerine eklendikten sonra rekombinasyona yatkın oldukları için işe yaramazlar. Bu nedenle cos siteleri aracılığıyla faj iletimi bu sorunun oluşmasını önlemek için kullanılır.
Plazmid ve Cosmid
• Plazmidler yalnızca 15 kb'ye kadar DNA eklentileri kabul ederken, kozmidler daha fazla DNA materyali (50kb'ye kadar) taşıyabileceğinden daha iyi olur • Bu yeteneğinden dolayı, yabancı DNA'nın daha büyük parçalarını klonlamak için kosmidler daha verimli kabul edilir. Genom fragmanlarının kütüphanelerini oluştururken tercih edilen vektörlerdir. |