Prokaryotlarla Ökaryot Arasındaki Fark Ökaryotlarda
Ökaryotların membrana bağlı çekirdekler içerdiğinden ve lizozomlar, Golgi kompleksi, endoplazmik retikulum, mitokondri ve kloroplastlardan başka organellerden oluştuğu, ökaryotlara 'gerçek çekirdek' denirken, prokaryotlarda nükleer membran veya diğer zar kapalı organelleri bulunmaz.
Prokaryotlarda, kamuflaj iki protein yapı taşından yapılır; ve hücre duvarı kimyasal olarak karmaşıktır ve peptidoglikandan (amino asitler ve şekerin tek bir büyük polimerinden) oluşur; ökaryotların kamçılıları ise çok sayıda mikrotübül ile daha karmaşıktır ve hücre duvarları mevcut olduğunda kimyasal olarak basittir.
Prokaryotlarda, hücre bölünmesi ikili fisyon yoluyla oluşur ve mayozlaşma gerçekleşmez, ancak DNA fragmanlarının aktarımı konjügasyon yoluyla gerçekleşir. Ökaryotlarda hücre bölünmesi mitoz yoluyla oluşur ve mayooz yoluyla cinsel üreme oluşur.
Ökaryotlarda plazma zarları sterol ve karbonhidrattan oluşur. Sitoplazma, sitoskeletondan oluşur ve sitoplazmik akış mevcut. Ribozomlar daha büyük (80S) ve daha küçük (70S) boyuttadır ve kromozomlar çokludur ve histonlarla doğrusal olarak düzenlenmiştir. Ökaryotların DNA'sı, prokaryotların DNA'sından çok daha karmaşıktır.