Kök ve Kökten Dışı Filogenetik Ağrı Arasındaki Fark | Köklü ve Köklenmemiş Filogenetik Ağaç
Anahtar fark - Köklü ve Kökten Dışı Filogenetik Ağaç
Filogenez, yeryüzündeki yaşamı zamanla keşfeden önemli bir alandır. Organizmalar, ataları ve torunlarıyla olan organizmaları birbirine bağlar. Organizmalar arasındaki ilişkiler, dendogram, cladogram, fenogram, filogram vb. Gibi çeşitli ağaç benzeri gösterimlerle diyagramatik olarak temsil edilir. Bir filogenetik ağaç, organizmalar arasındaki evrimsel mesafe miktarı arasındaki filogenetik ilişkileri açıklayan, dallara bölünmüş ağaç benzeri bir diyagramdır. Köklü ve kökten çıkarılmış olarak bilinen iki ana filogenetik ağaç türü vardır. Köklü ve kökten çıkarılmayan filogenetik ağaç arasındaki en önemli fark, köklü ağaç, ağacının en temel atasını gösterirken, kökten çıkmayan filogenetik ağaç, bir atasal kök göstermez.
İÇİNDEKİLER
1. Genel ve Anahtar Farkı
2. Köklü Bir Filogenetik Ağacı Nedir
3. Köklenmemiş Filogenetik Ağacı Nedir
4. Yan yana Karşılaştırma - Köklü ve Kökten Dışı Filogenetik Ağaç
5. Özet
Köklü Bir Filogenetik Ağaç Nedir?
Köklü bir filogenetik ağaç, evrim tarihini gösteren yararlı bir diyagram olarak işlev görür. Ağacın tüm gruplarının ortak atasını temsil eden kök adı verilen bir bazal düğüm vardır. Bir ağacın kökü, ağacın içerdiği tüm grupların son ortak atasını temsil eden ağacın en eski noktası olarak düşünülür. Dolayısıyla, köklü bir ağaç evrimsel zamanın yönünü gösterir. Köklü bir ağacın tek bir türüne göre, ortak ata veya tür atası, bazal düğüme geri izlenerek bulunabilir. Köklü ağaç evrimsel zamanın yönünü tasvir ettiğinden sahip olduğu eski veya yeni grupları bulmak kolaydır. Tüm organizmalar grubunu incelemek için köklü bir ağaç kullanılabilir. Doğru olmayan köklenme, organizmalar arasındaki genetik değişikliklerin yanlış yorumlanmasına ve evrimin yönlülüğüne neden olabileceğinden, bir filogenetik ağacın doğru kök salması önemli ve önemli bir faktördür.
Şekil 01: Köklü Bir Filogenetik Ağaç
Unrooted Filogenetik Ağacı Nedir?
Köklenmemiş bir filogenetik ağaç, ortak bir ata ya da bazal bir düğüme sahip olmayan bir filogenetik diyagramdır. Bu ağaç türü, ilgi gruplarının evriminin kökenini göstermez.Evrimsel zaman çizgisinin yönü ne olursa olsun organizmalar arasındaki ilişkiyi gösterir. Bu nedenle, ağaçsız bir ağaç kullanarak zamanla grupların evrimsel ilişkilerini incelemek zordur.
Kökleştirilmemiş bir filogenetik ağacın köklenmesinde iki ana yol vardır.
- Bir outgroup bulmak - Bu, takson arasındaki ilişkiler konusunda önceden bilgi gerektirir. Daha sonra grubun dışındaki bir takson köklü bir filogenetik ağacı çizmek için bir dış grup olarak kullanılabilir
- Orta noktayı veya mesafeyi bulma - Ağacın en uzaktaki iki taksonunun orta noktası filogenetik ağaca kök olarak düşünülebilir.
Şekil 02: Kayıtsız Filogenetik Ağaç
Kök ve Kökten Dışı Filogenetik Ağa arasındaki fark nedir?
- diff Makale Tablosunun Ortasından Önce Orta ->
Köklü ve Köklü Olmayan Filogenetik Ağaç |
|
| Köklü bir filogenetik ağaç, grupların son ortak atasını gösteren bir diyagramdır. | Kökleşmemiş bir filogenetik ağaç, ortak ataları göstermeksizin organizmalar arasındaki ilişkileri gösterir. |
| Düğüm | |
| Bir düğüm (kök) vardır. | Bir düğüm yok. |
| Evrim Yönü | |
| Evrimsel zamanı belirtmek için bir yön vardır. | Evrimsel bir ilişki belirtilmemiştir. |
| Başkalarına Karşı Tutum | |
| Ağaç, gruplar arasındaki ata - torun ilişkisini belirlemeye izin verir. | Ağaç, ata - torun ilişkisi hakkında konuşmaya izin vermiyor. |
Özet - Köklü ve Kökten Dışı Filogenetik Ağaç
Bir filogenetik ağaç, dallı ağaç benzeri diyagramlar kullanarak organizmalar arasındaki evrimsel yolakları ve bağlantıları temsil eder. Filogenetik tress köklü veya kökten çıkarılabilir. Köklü bir ağacın tabanında, tüm ilgi gruplarını birbirine bağlayan ortak atayı temsil eden bir düğüm bulunur. Kökleşmemiş bir ağaç, organizmalar arasındaki ilişkileri gösterir. Bununla birlikte, tüm grupların paylaştığı ortak atayı tasvir etmez. Bu, köklü ve kökten çıkarılmamış filogenetik ağaç arasındaki farktır.
Kaynaklar:
1. "Ağaç" Gerçekler: Köklü ve Ağaçlanmamış Ağaçlar. "Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi. Ulusal Tıp Kütüphanesi, n. d. Ağ. 04 Nisan 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead ve Spencer C. H. Barrett. "Kötü Gruplarla Kökleşen Filogenetik Ağaçlar: Commelinoid Monokotlardan Bir Örnek Vaka. "Moleküler Biyoloji ve Evrim. Oxford University Press, 01 Ekim 2002. Web. 04 Nisan 2017
