SDS PAGE ve Jel Elektroforezi Arasındaki Fark

SDS PAGE vs Jel Elektroforez

. DNA sicili, kimyasallara kazandırıldığında bilgi sürecini hızlandırabilir veya yavaşlatabilir. Bilinen kitlenin DNA işaretleri, elektroforez sona erdikten sonra hareket eden cisimlerin büyüklüğünü bulmak için kullanılır. Elektroforez, moleküler biyologlar ve biyokimyacılar için en çok kullanılan araçtır.

Bu işlemde yaygın olarak kullanılan iki elektroforez çeşidi vardır. Bunlar sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi (SDS-PAGE) ve doğal jel elektroforezidir.

SDS-PAGE, proteinleri elektroforetik hareketliliğinden ayırmak için biyokimya, adli tıp, biyoloji ve genetik gibi alanlarda kullanılan jel elektroforezinin seçici olmayan bir yöntemidir. SDS, DNA ekstraksiyonu sırasında ve SDS-PAGE'de proteinlerin ayrıştırılması sırasında hücrelerin parçalanmasına yardımcı olmak için kullanılabilen anyonik bir yüzey aktif maddedir. Elektroforez esnasında, bir SDS çözeltisinde bir protein karışımı önce sıvılaştırılır. Daha sonra proteini lineer hale getirmek için disülfid bağlarını çıkarmak için Mercaptoetanol adlı bir madde uygulanır. Daha sonra elektroforez başlatılır. Sonuçlar, biri SDS-PAGE olan iki molekül kalıntısı verecekti.

SDS-PAGE'in yokluğu bir sorun değildir; çünkü jel elektroforezi sadece proteinler ikincil ve üçüncül yapılarını kaybetmemekte ve genellikle düz çubuklara açılmamaktadır.

Bu esnada, yerli jel elektroforezi antikorvektif bir ortam olarak jel kullanır. Genellikle DNA, ribonükleik asit (RNA) ve protein gibi biyolojik makromoleküllerin ayrılması için kullanılır. Nanoparçacıkların ayrılması için de kullanılabilir.

Doğal jel elektroforezinde kullanılan iki temel jel, yani:

Agaroz jeli daha büyük moleküller için kullanılır. Bu jel, iki moleküler bant arasındaki küçük farklılıkları tanımlamaz. Ayrıca sadece DNA'nın ayrılması için de kullanılır. Agaroz jelin görselleştirilmesi etidyum bromürün karışımı ile yapılır.

Daha küçük moleküller için kullanılan poliakrilamid jel. Bu jel, moleküler bantlar arasındaki farkları tanımlar. DNA'dan başka proteinleri de ayırabilir.

Özet:

1. SDS-PAGE, proteinleri elektroforetik hareketliliğinden ayırmak için biyokimya, adli tıp, biyoloji ve genetik gibi alanlarda kullanılan jel elektroforezinin seçici olmayan bir yöntemidir; jel elektroforezi, DNA, ribonükleik asit gibi biyolojik makromoleküllerin ayrılması için genellikle kullanılır (RNA) ve protein. Nanoparçacıkların ayrılması için de kullanılabilir.

2. Doğal jel elektroforezinin iki tipi vardır: agaroz jel ve poliakrilamid jel.