Upstream ve Downstream DNA Arasındaki Fark | Upstream ve Downstream DNA
Anahtar Difference - Upstream vs Downstream DNA
Yukarı ve aşağı DNA arasındaki farkı anlamak için DNA'nın yapısı ve yapısı hakkında genel bir bilgiye sahip olmak önemlidir. DNA polinükleotid zincirlerinden oluşur. Nükleotidler polinükleotit zincirleri oluşturan yapı taşlarıdır ve her bir nükleotid üç bileşenden oluşur: beş karbonlu şeker, azotlu bir baz ve bir fosfat grubu. Bir fosfat grubu ve bir OH grubu sırasıyla bir nükleotiddeki şeker molekülünün 5 'pozisyon karbon ve 3' pozisyon karbonuna bağlanır. Nükleotidler, bir nükleotidin 5 'fosfat grubu ve bitişik nükleotidin 3'OH grubu arasında oluşan fosfodiester bağları ile birleştirilir. Bir polinükleotid zincir serbest 5 'fosfat grubuna sahipse, 5' ucu olarak atanır; eğer serbest bir 3'OH grubuna sahipse, 3'üncü olarak atanır. Bu nedenle, DNA zincirleri genelde polinükleotid zincirlerinin uç konumlarına göre 5 've 3' uçlarına sahiptir. DNA da çift sarmallı form olarak bulunur. İki iplikçik birbirine ters orantılıdır. Dolayısıyla DNA, 5 'ile 3' yön ve 3 'ile 5' yönlerine doğru ilerleyen iki büküme sahiptir. Yukarı ve aşağı DNA, 5 'ila 3' mRNA ipliğinin transkripsiyonu ve sentezi referans alınarak atıf yapılır. Eğer DNA, transkripsiyon başlatma sahasındaki kodlayıcı iplikçiklerinin 5 ucuna doğru düşünülürse, yukarı akış DNA'sı olarak bilinir. DNA, transkripsiyon başlatma sahasındaki şifreleme sarmalından 3 'uca doğru düşünülürse, aşağı doğru DNA olarak bilinir. Bu akış yukarı ve aşağı DNA arasındaki temel farktır.
İÇİNDEKİLER
1. Genel ve Anahtar Farkı
2. Upstream DNA nedir
3. Aşağı-akışkan DNA nedir
4. Yan yana Karşılaştırma - Upstream ve Downstream DNA
5. Özet
Üstteki DNA nedir?
Bir gen, bir organizmanın DNA'sında bulunan bir yapısal ve işlevsel birim kalıtımsallığıdır. Bir protein oluşturmak için talimatlarla birlikte saklanır. Gen bir DNA molekülünün spesifik bir bölgesine sahiptir. Gerektiğinde, bir mRNA ipliğinin sentezi yoluyla bir proteine yazar ve tercüme eder. Genellikle, genin bir kodlama zinciri 5 'ile 3' yönlerine kadar uzanır. Transkript edildiğinde, 5 'ile 3' arasındaki aynı yönde bir mRNA ipliği üretir. Transkripsiyon sırasında, 3 'ila 5' antisens iplikçik şablon iplikçik olarak servis edilir ve mRNA sentezini başlatır. Gen içinde bir transkripsiyon başlatma bölgesi vardır. Transkripsiyon başlatma sahasına atfen, kodlayıcı iplikçiklerinin 5 'ucuna doğru olan DNA bölgesi yukarı akış DNA'sı olarak bilinir.Genin bir promoteri normal olarak DNA'nın yukarı akış bölgesinde bulunur. Ökaryotik genlerde, TATA kutuları, promoter proksimal elemanlar ve genin üst kısmındaki arttırıcılar bulunur. Genin yukarı akış bölgesi negatif sayılarla ifade edilir. Bir genin üst akış DNA'sı transkripsiyon için son derece önemlidir.
Downstream DNA nedir?
Transkripsiyon başlatma bölgesi bir genin +1 noktası olarak bilinir. +1 noktasından kodlama ipliğinin 3 'ucuna doğru olan DNA bölgesi aşağı akış DNA'sı olarak bilinir. Başka bir deyişle, genin aşağı yönü şablon iplikçiklerinin 5 'ucuna doğru transkripsiyon başlatma mevkisinden gelmektedir. Dolayısıyla bir gen bölgesinin aşağı akış DNA'sı, transkripsiyonel birimi ve sonlandırma dizisi gibi diğer dizileri içerir. Destekleyici, bir genin aşağı akım dizisini etkileyebilir. Bir genin aşağı akan kısmı pozitif sayılarla belirtilir. Bir genin aşağı akış DNA'sı, protein ürününü veren gerçek bölgedir.
Şekil 01: Upstream ve Downstream DNA'sı
Upstream ve Downstream DNA'sı arasındaki fark nedir?
- diff Makale Tablo ->
Yukarıdan Aşağıya Akan DNA'ya |
|
| Sonlandırma öncesi DNA olarak bilinen kodlama dizisinin 5 'ucuna doğru olan DNA bölgesi yukarı akış DNA'sı olarak bilinir. | Kodlama ipliğinin 3 'ucuna doğru transkripsiyon başlatma bölgesine ait DNA bölgesi aşağı akış DNA'sı olarak bilinir. |
| Elemanlar | |
| Destekleyiciler ve arttırıcılar, akış yukarı DNA | Transkripsiyon ünitesinde bulunur ve sonlandırma sekansları, aşağı doğru DNA'da bulunur. |
| Numaralandırma | |
| Yukarı akış bölgesinde yer alan nükleotidler, nolu negatif sayı ile belirtilir. Nükleotidler pozitif sayılarla belirtilir. | İşlev |
| Bu bölge, transkripsiyonun düzenlenmesi ve başlatılması için gerekli elementleri içerir | |
| Bu bölge, bir protein üretmek ve transkripsiyonu sona erdirmek için talimat içerir. Özet - Upstream ve Downstream DNA | Yukarı akış yönünün tanımlanması kolaydır ve bir RNA zincirinin akış aşağısında. Referans bölgesi ile ilgili olarak, RNA ipliğinin 5 'ucuna doğru bölge yukarı akış RNA'sı olarak bilinirken, 3' ucuna doğru bölge aşağı akış RNA'sı olarak bilinir. Bununla birlikte, DNA'da, her iki yönde de 5 'ila 3' ve 3 'ila 5' arasında uzanan iki iplik vardır. Dolayısıyla, yukarı ve aşağı DNA arasındaki fark karmaşıktır. Bu nedenle, bir genin transkripsiyonuna atıfta bulunarak ayırt edilir. Transkripsiyon başlatma sahasından duyu ipliğinin 5 ucuna doğru DNA bölgesi yukarı akış DNA'sı olarak bilinirken, transkripsiyon başlatma alanından duyu ipliğinin 3 'ucuna aşağı akış DNA'sı olarak bilinir. Bu, DNA'nın yukarı ve aşağı akışları arasındaki farktır. |
Kaynaklar:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi ve Jonatha M. Gott. "Physarumediting sitelerinin akış yukarı ve akış aşamalarında farklı roller. "RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Eylül 2009. Web. 18 Mart 2017
Resim Nezaketleri:
1.Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro ve Luísa Romão. "Upstream Açık Okuma Çerçeveleri ve İnsan Hastalıkları İle Gen İfade Düzeni. "PLOS Genetiği. Halk Kütüphanesi, n. d. Ağ. 18 Mart 2017.
