Baz Eksizyon Tamiri ve Nükleotid Eksizyon Onarma Arasındaki Fark | BER vs NER
Anahtar Farklılık - Baz Eksizyon Onarımı vs Nükleotid Eksizyon Onarımı
DNA sıklıkla uygulanır çeşitli iç ve dış etkenlerden dolayı zarar görmesi. Bununla birlikte, hücresel tamir sistemleri, mutasyona uğramadan veya sonraki kuşaklara geçmeden önce zararları derhal ve sürekli olarak düzeltir. Hücrelerde üç tür eksizyon tamir sistemi vardır: tek sicimli DNA hasarlarını onarmak için nükleotid eksizyon tamiri (NER), taban eksizyon tamiri (BER) ve DNA uyuşmazlığı onarımı (MMR). Temel eksizyon tamiri ve nükleotid eksizyon tamiri arasındaki en önemli fark, baz eksizyon tamiri, hücrelerde, endojen olarak olan tek nükleotid hasarını onarmak için çalışan basit bir onarım sistemidir; nükleotid eksizyon tamiri, kompleks tamirdir Hücrelerde çalışan ve daha büyük, hasar gören bölgeleri onarmak için çalışan sistem, ekzojen bir şekilde yol açtı.
İÇİNDEKİLER
1. Genel ve Anahtar Farkı
2. Baz Düzeltme Onarım Nedir 3. Nükleotid Eksizyon Onarımı nedir
4. Yan İçi Karşılaştırma - Baz Eksizyon Onarımı vs Nükleotid Eksizyon Onarımı
5. Özet
Baz Eksizyon Onarımı nedir?
Temel eksizyon tamiri, hücrelerin DNA onarım sisteminin en basit versiyonudur. DNA'daki küçük hasarları onarmak için kullanılır. DNA bazları, deaminasyon veya alkilasyon nedeniyle modifiye edilir. Temel zararlar olduğunda, DNA glikozilizazı, baz eksizyon tamir sistemini tanır ve etkinleştirir ve enzimleri AP endonükleaz, DNA polimeraz ve DNA ligaz enzimi yardımıyla geri kazandırır. Aşağıdaki adımlar BER sisteminde yer almaktadır.
- Apazinik / apyrimidinik endonükleaz ile abasik bölge insizyonu
- Geri kalan şeker parçacıklarının bir liyaz veya fosfodiesteraz ile giderilmesi
- Bir DNA polimerazı ile boşluk doldurma
- Bir DNA ligazı ile lekenin sızdırmazlığı
Şekil 01: Temel eksizyon onarım yolu
Nükleotid Eksizyon Onarımı nedir?
Nükleotid Eksizyon Onarımı (NER) hücrelerde önemli bir DNA eksizyon tamir sistemidir. Hasar gören 30 baza kadar hasar gören bölgeyi onarabilir ve yerinden değiştirebilir ve hasarsız şablon şeridi tarafından yönlendirilir.Ortak DNA hasarları morötesi radyasyona bağlı olarak meydana gelir ve NER, bu hasarları mutasyona uğratmadan hemen sonra tamir ederek DNA'yı korur ve gelecek kuşaklara geçerek veya hastalıklara neden olur. NER, özellikle çevresel ve kimyasal kanserojenler gibi dışsal faktörler nedeniyle dolaylı olarak meydana gelen mutasyonlara karşı koruma sağlar. NER hemen hemen tüm organizmalarda görülür ve DNA sarmalında belirgin bozulmalara neden olan hasarları tanır.
NER işlemi, XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, vb. Gibi birçok proteinin eylemini içerir ve çeşitli kesme ve yapıştırma benzeri mekanizmalar yoluyla ilerlemektedir. Bu proteinler onarım sürecinin tamamlanması için gereklidir ve NER proteinlerinden birindeki bir defekt yaşamsaldır ve nadir görülen resesif sendromlara neden olabilir: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne sendromu (CS) ve kırılgan saç köklerinin ışığa duyarlı formu trichothiodystrophy (TTD).
Şekil 02: Nükleotid Eksizyon Onarımı
Temel Eksizyon Onarımı ve Nükleotid Eksizyon Onarımı arasındaki fark nedir?
- diff Makale Tablo ->
Altında Baz Eksizyon Onarımı vs Nükleotid Eksizyon Onarımı |
|
| Baz eksizyon tamiri (BER), hücrelerde oluşan bir DNA tamir sistemidir. | Nükleotid eksizyon tamiri (NER), hücrelerde bulunan başka bir DNA onarım sistemidir. |
| DNA Katkı Maddelerinin Tanınması | |
| BER, küçük DNA adüklerine hasarları onarır. | NER büyük DNA adükleri onarır. |
| DNA hasarları | |
| BER, DNA sarmalında belirgin bozulmalara neden olmayan zararı tanımaktadır. | NER, DNA helezonunda önemli bozulmalara neden olan hasarları tanır. |
| DNA Hasarının Sebepleri | |
| BER, endojen mutajenlerin neden olduğu zararları onarır. | NER, ekzojen mutagenlerin neden olduğu zararları onarır. |
| Karmaşıklık | |
| BER, en az kompleks onarım sistemidir | BER'den daha karmaşıktır. |
| Proteinler için ihtiyaç | |
| BER, diğer proteinleri gerektirmez. | NER, zarar görmüş ve hasar görmemiş bölgelerin ayırt edilmesi için, özellikle proteinler olmak üzere birçok gen ürününe ihtiyaç duyar. |
| Uygunluk | |
| BER, tekli baz hasarlarını düzeltmek için uygundur. | NER hasarlı bölgelerin değiştirilmesi için uygundur. |
Özet - Baz Eksizyon Onarımı vs Nükleotid Eksizyon Onarımı
NER ve BER, hücrelerde bulunan iki DNA eksizyon tamir işlemi tipidir. NER çoğunlukla ekzojen olarak oluşan 30 baz çifti uzunluğundaki hasar bölgelerini tamir ederken BER, endojen olarak oluşan küçük hasarları onarabilir. BER, tanınan substratlar ve ilk bölünme olayında NER'den farklıdır. BER, DNA sarmalında önemli çarpıklıklardan kaynaklanmayan hasarları da tanıyabilirken, NER de DNA sarmalının çarpıklıklarını tanır. Bu temel eksizyon tamiri ve nükleotid eksizyonu arasındaki farktır.
Resim Nezami:
1. "Dna onarım temel excersion tr" By LadyofHats - (Kamusal Alan) Commons Wikimedia aracılığıyla
2. "Uvr proteinleri tarafından kontrol edilen nükleotid eksizyon tamir yolu için modellerin şematik bir gösterimi" Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui ve Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) Commons Wikimedia aracılığıyla
Kaynakça:
1. Kim, Yun-Jeong ve David M. Wilson. "Temel Eksizyon Onarımı Biyokimyasına Genel Bir Bakış. "Mevcut moleküler farmakoloji. Ulusal Tıp Kütüphanesi, Ocak 2012. Web. 14 Mart 2017.
2. Boer, Jan De ve Jan H. J. Hoeijmakers. "Nükleotid eksizyon tamiri ve insan sendromları. "Kanser oluşumu. Oxford University Press, 01 Mart 2000. Web. 28 Mart 2017
3. Hoogstraten ve ark. "Küresel genom nükleotid eksizyon tamir proteini XPC'nin sunduğu çok yönlü DNA hasar tespiti. "Hücre Bilimi Dergisi. Biyologlar Şirketi Şirketi, 01 Eylül 2008. Web. 28 Mart 2017
