Künt ve Yapışkan Son Ligasyon Arasındaki Fark | Künt-Yapışkan Son Bağlama

Anahtar Farkı - Künt ve Yapışkan Son Ligasyon

Kısıtlama endonükleazları, çift sicimli DNA'yı (dsDNA) kesen spesifik enzimlerdir. Moleküler biyolojide moleküler makas olarak da bilinirler. Restriksiyon enzimleri tanıma bölgeleri olarak bilinen dsDNA'nın spesifik kısa dizilerini tanıyabilir ve fosfodiester ve hidrojen bağlarını açarak çift bükümler açabilir. Bu enzimlerin bölünmesi sonucunda DNA parçaları, yapışkan uçlar ve kör uçlar gibi farklı uç türleri ile üretilir. DNA ligaz Moleküler biyolojide yeni bağlar kurarak iki bitişik DNA zincirine katılmak için kullanılan bir enzimdir. Adım ligasyon olarak bilinir ve bağlanan DNA ucunun türüne göre künt uç ligasyonu ve yapışkan uç ligasyonu olarak adlandırılabilir. Künt ve yapışkan uç ligasyonu arasındaki en önemli fark, künt uç ligasyonu, iki künt uç içeren DNA fragmanları arasında oluşurken yapışkan uç ligasyonu, 5 've 3' çıkıntılar arasında meydana gelir. Kör uç ligasyonla karşılaştırıldığında yapışkan uç ligasyonu daha verimli ve kararlıdır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel ve Anahtar Farkı

2. Kör Bitki Bağlama Nedir

3. Yapışkan Uç Bağlama Nedir

4. Yan yana Karşılaştırma - Künt Yapışkanlı Yapışkan Son Bağlama

5. Özet

Blunt Son Bağlantısı Nedir?

Bazı kısıtlama endonükleazları DNA'yı zıt bazlardan kesebilir ve kör uç DNA fragmanları üretebilir. Bu enzimler künt uçlu kesiciler olarak bilinir; kısıtlama alanının ortasına, tek telli çıkıntılı tabanlardan ayrılmadan doğrudan ayrılırlar. Kör uçlar, uçlarında 3 've 5' çıkıntılı bazlara sahip olmadığı için çıkıntı yapmayan uçlar olarak da bilinirler. Her iki iplikçik de kör uçlardaki baz çiftlerinden son bulur. Genel küt uçlu kesme enzimleri EcoRV HaeIII, AluI ve SmaI'dir.

Künt uç ligasyonu iki kör uç arasında yer alır. Çıkıntılı bazların bağlanması değil. Bu ligasyon, yapışkan son bağlamadan daha az verimlidir. Bununla birlikte, bazı durumlarda, künt uç ligasyonu, özellikle PCR ürünlerini bağlarken, yapışkan uç ligasyondan daha avantajlıdır. PCR ürünleri her zaman künt uçlarla üretilir. Kör uç bağlama, ligasyon için DNA'da tamamlayıcı uçlar gerektirmez.

Şekil 01: Eco RV enzimi ile kör son üretim

Yapışkan son ligasyon nedir?

Bazı kısıtlama endonükleazları dsDNA'yı kesebilir, sonunda tek sarmallı bir DNA parçasını bırakır. Bu uçlar yapışkan veya çıkıntılı uçlar olarak bilinir. Yapışkan bitim ligasyonu eşleşen çıkıntıları içeren iki DNA fragmanı arasında oluşur, çünkü yapışkan uçlara eşleşmemiş bazlar bulunur ve bağlar oluşturmak için tamamlayıcı bazlar gerekir. Dolayısıyla, eşleşen ligat fragmanları üretmek için her iki DNA kaynağı için aynı kısıtlama enziminin kullanılması gereklidir.

Yapışkan son bağlanma daha verimli ve genellikle klonlama işlemlerinde çok arzu edilir. Yapışkan uçlar üreten birkaç kısıtlama enzimi vardır. Bunlar EcoRI, BamHI, HindIII vb.

Şekil 02: EcoRI enzimi ile yapışkan son üretim

Blunt ve yapışkan uç ligasyonu arasındaki fark nedir?

- Tablo arasındaki fark Madde Orta ->

Künt ve Yapışkan Son Ligasyon
İki künt uç DNA fragmanı arasında künt uç ligasyonu oluşur.	Yapışkan uç bağlaması, yapışkan uçları olan iki eşleşen DNA fragmanı arasında gerçekleşir.
Enzimler
Künt uçlu kesiciler küt uçlar üretir.	Yapışkan uçlu kesiciler yapışkan veya yapışkan uçlar üretir.
Eşleşen Bitiş Gereksinimleri
Eşleşen fragmanları veya tamamlayıcı üsleri gerektirmez.	Bit çiftlerini oluşturmak için uçlarda tamamlayıcı bazlar gerekir.
Verimlilik
Yapışkan son bağlamadan daha az verimlidir	Künt uç ligasyonundan daha etkilidir.

Özet - Künt ve Yapışkan Son Ligasyon

Kısıtlayıcı endonükleazlar, dsDNA'yı parçalayabilir ve farklı uçlara sahip DNA fragmanları üretebilir. Belli dizileri tanımakta ve yapışkan ve kör uçlar üreten DNA'yı sınırlamaktadırlar. Yapışkan uçların parçalarının sonunda eşleştirilmemiş bazları vardır. Kör uçlar düz bir yarılma nedeniyle oluşur ve uçlarında baz çiftleri bulunur. Yapışkan son ligasyon iki tamamlayıcı tek sarmal DNA parçasını gerektirir. Künt uç ligasyonu, herhangi bir iki kör uç parçası arasında meydana gelir. Bu, künt ve yapışkan ligasyon arasındaki farktır.

Kaynaklar:

1. Roberts, Richard J. "Kısıtlama enzimleri, moleküler biyolojinin ataları olarak nasıl kullanılırdı. "Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. Ulusal Acad Bilimleri, n. d. Ağ. 12 Nisan 2017

2. Adnan, Amna. Biyoteknolojide Kısıtlayıcı Enzimlerin Kullanımı. N. s., n. d. Ağ. 12 Nisan 2017

Resim Nezaketleri:

1. "EcoRV Sınırlandırma Sitesi. rsh "Ramin Herati - Inkscape (Kamusal Alan) ile Commons Wikimedia

2 ile oluşturuldu. "Restriksiyon enzimi Eco RI" Tinastella Tarafından - Kendi çalışması (Kamu Alanı) Commons Wikimedia'dan